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电机与仪器档案盒之间存在明显的区别，主要如下：
1、功能与用途：电机档案盒主要用于存放电机相关的文件、图纸、维修记录等；而仪器档案盒则主要用于存放仪器使用说明、校准记录、检测数据等。
2、结构与外观：电机档案盒根据其设计，可能需要考虑到存放较大或较复杂的文件，因此可能有不同的内部隔层设计；仪器档案盒通常用于存放纸质文档或小型仪器，因此其结构和外观相对简单。
至于电机与仪器档案盒的距离，这主要取决于实际的应用环境和需求，如果电机和仪器是分开存放的，那么它们的档案盒距离可能会较远，但如果是在同一空间或设备内，考虑到方便取用和管理的需要，其距离可能会较近，这个问题没有一个固定的答案，需要根据具体情况进行分析。
仅供参考，如需更多关于电机与仪器档案盒的信息，可以咨询相关行业的从业人员，或访问专业论坛获取。